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Dental Tribune Édition Française No.11, 2016

19 Dental Tribune Édition Française | Novembre 2016 CONFÉRENCE À VENIR SPÉCIALADF alimentaire affectent la composition du microbiome oral des individus (1) . Dans l’his- toire de l’humanité, ces transitions écolo- giquesontfavoriséledéveloppementdespa- thogènes dentaires, de la carie et des paro- dontopathies, à partir d’un microbiome oral initialement sain et équilibré, principale- ment lors de deux périodes : – le Néolithique, marqué par le début de l’agriculture et le passage d’une alimenta- tion riche en fibres et protéines à une ali- mentation riche en céréales. – la Révolution Industrielle (XVIIIe siècle) et l’apparition dans l’alimentation de sucres raffinés transformés. Récemment,lamétagénomiqueetlesnou- velles techniques de séquençage haut débit, de type « Next Generation Sequencing » (NGS), ont révolutionné le domaine de la paléogénétique en permettant l’accès aux génomesetauxmicrobiomesanciensdema- nièreexhaustiveetprécise.Danscetteappro- che, la dent est un support anthropologique de choix, puisqu’elle renferme une quantité importante de molécules ADN du micro- biome oral, permettant de rechercher spéci- fiquement certaines bactéries commensales ou pathogènes présentes en bouche. a) Objectifs Nous avons étudié le microbiome oral de six sujets issus d’une population rurale fran- çaise du XVIIIe siècle. Ces sujets ont été sélec- tionnés après analyse macroscopique et radiologique, en fonction des pathologies bucco-dentaires retrouvées sur les dents et les mâchoires (figure). Nous avons cherché, 1) à mettre en évidence des communautés bactériennes appartenant au microbiome oral;2)àidentifierspécifiquementdesbacté- riesresponsablesdelacarieetdelaparodon- tite; 3) à relier les bactéries commensales ou pathogènes aux pathologies identifiés macroscopiquement sur chaque sujet. b) Méthodes : 1) Analysemacroscopique:nousavonsrelevé les signes infectieux présents sur les dents etlesmâchoiresdesixsujets :cariesdentai- res, perte osseuse liée à une parodontopa- thie ;lésionsostéolytiquesliéesàdesabcès péri-apicaux ou à des kystes résiduels. 2)Analysemétagénomique:sixdentsontété traitées dans un laboratoire de paléogéné- tique dédié (2) . Les communautés microbi- ennes commensales et pathogènes ont été séquencées par shotgun (sur HiSeq 2500 Illumina)etl’analysedesdonnéess’estfaite via MetaphlAn et mapping. c) Résultats et conclusion Nous avons identifié des communautés bactériennes commensales et pathogènes responsables notamment de la carie, des in- fections parodontales et péri-apicales. Sur cinqdessixdentsétudiéessontcaractérisées entre autres : Pseudoramibacter alactolyti- cus,Streptococcussanguinis,Rothiadentoca- riosa, Parvimonas micra. Streptococcus mu- tans, chef de file des bactéries responsables de la carie dentaire et Porphyromonas gingi- valis, impliquée dans les maladies parodon- tales sont abondement présentes dans ces échantillons anciens. Cesrésultatssontenaccordaveclespatho- logies observées macroscopiquement ainsi qu’avec les données historiques de l’époque etnousmontrentdesmicrobiomesorauxri- ches et spécifiques à chaque individu. Ils off- rent également aux odontologistes et aux anthropologuesunepremièrevisiondel’état sanitairebucco-dentairedecettepopulation rurale du XVIIIe siècle. 1. Adler CJ, Dobney K, Weyrich LS, Kaidonis J, Walker AW, Haak W, et al. Sequencing an- cientcalcifieddentalplaqueshowschanges in oral microbiota with dietary shifts of the Neolithic and Industrial revolutions. Nat Genet. 2013;45(4):450-5e1. 2. Theves C, Senescau A, Vanin S, Keyser C, Ri- cautFX,AlekseevAN,etal.Molecularidenti- fication of bacteria by total sequence scree- ning: determining the cause of death in an- cient human subjects. PLoS One. 2011; 6(7):e21733. La spectrométrie de masse MALDI-TOF :intérêt dans le suivi des bactéries au sein d’un modèle de biofilm D. Nguyen-Lopez, A. Ducourneau, M. Saint- Marc, O. Claisse, E. Bessède, F. Mégraud, C. Badet, J. Samot* L’écosystème buccal abrite plus de 700 espèces bactériennes dont l’identification semble indispensable, en particulier dans la compréhension de leur implication dans les MOREINVENTIVE LESSINVASIVE* TECHNOLOGIESDENTAIRES&MÉDICALES STAND 1L24 *Plus innovant, moins invasif 17 av. Gustave Eiffel BP 30216 33708 MERIGNAC cedex FRANCE www.acteongroup.com info@acteongroup.com 17 av. Gustave Eiffel BP 3021633708 MERIGNAC cedex FRANCE

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